药王菩萨与药上菩萨，有时取代文殊、普贤菩萨，作为释迦牟尼佛的左右胁侍。其实药王菩萨就是文殊菩萨，而药上菩萨就是普贤菩萨。药王与药上菩萨同施良药予众生，以治彼等身心病苦的菩萨，因供养比丘僧众，并施药救人，得众人赞赏，故被分别尊称为“药王”和“药上”
《佛说观药王药上二菩萨经》上详细记载了药王菩萨名号的由来：“过去无量无边阿僧祇劫，有佛号曰琉璃光照如来，彼佛涅槃后，于像法中，有日藏比丘，聪明多智，为大众广说大乘如来之无上清净平等大慧。时众中有星宿光长者，闻说大乘平等大慧，心生欢喜，以雪山之良药，供养日藏比丘及众僧，并发愿以此功德回向无上菩提，若有众生闻己名者，愿其得灭除三种病苦。时长者之弟电光明，亦随兄持诸醍醐良药供养日藏及诸僧众，亦发大菩提心，愿得成佛。星宿光长者、长者之弟电光明后即为药王、药上二位菩萨。”
《法华经》时说：“药王者，过去世以药救病，因以为名。”
解读：
星宿光长者就是妙光菩萨，即文殊菩萨，即万星之主紫微星。星宿都是八地及以上菩萨，都有先天一炁之法身，法身即大药，法身之主即法身佛文殊菩萨，所以药王菩萨就是法身佛文殊菩萨。电光明即能放电，即为雷，震木为雷，故电光明代表木灵，为没有分阴阳的太素木，即会打雷闪电的帝释天。木带着火快速奔跑为电光，闪电娘娘就是帝释天。有风雷两翅的雷祖让主宰阴炁的阴木和主宰阳炁的阳木合一为太素木时即打雷闪电，木龙天蓬元帅也称太乙雷使。
《法华经》卷七妙庄严王本事品载：于过去无数劫，有云雷音宿王华智佛，说法华经。时有国王名妙庄严（梵Śubha -vyūha ），夫人名净德（梵Vimala -datta ），二子名净藏、净眼。其王邪见炽盛，信外道之法。夫人与二子乃共设种种方便，使王至宿王华智佛所，听闻法华经，共得利益。净藏、净眼二人即今药王、药上二菩萨。
解读：
法身清净，藏而不可见，故称净藏，即如来藏，即先天一炁，净藏菩萨即药王菩萨，即文殊菩萨。净眼即有清净法身的千眼观世音菩萨，即眼光娘娘，即泰山的碧霞元君，即普贤菩萨。艮土之中有“目”，故净眼即后土娘娘，即地母观音。
《法华经》卷六药王菩萨本事品载：有日月净明德如来，其佛寿命为四万二千劫。时有一菩萨，名‘一切众生喜见菩萨’，修习苦行，精进经行，一心求佛，经一万二千岁，证得‘现一切身色三昧’，乃服诸香，饮香油，燃自身供养佛一千二百年。命终后复化生于净德王之家，受日月净明德如来之付嘱，于彼佛灭度后造八万四千塔。其自身亦于七万二千年间，燃臂供养其塔。彼‘一切众生喜见菩萨’即今之药王菩萨。
解读：
文殊菩萨现在于北方作佛，称为欢喜藏摩尼宝积。文殊菩萨即法身佛，即道，故为一切众生所喜见，所以“一切众生喜见菩萨”之药王菩萨即文殊菩萨，即道上帝
《佛说观药王药上二菩萨经》中初观药王菩萨功德相貌部分云：“药王菩萨身长十二由旬。随应众生或十八丈或现八尺。身紫金色三十二相八十随形好如佛无异。顶上肉髻有十四摩尼珠。其一一珠有十四楞。一一楞间有十四华。以严天冠。其天冠内有十方佛及诸菩萨。皆悉影现如众宝窴。眉间毫相白琉璃色。绕身七匝如白宝帐。身诸毛孔流出光明。如摩尼珠数满八万四千。其一一珠宛转右旋。如七宝城优钵罗华。一一华上有一化佛。方身丈六如释迦牟尼。
解读：
“身诸毛孔流出光明”就是妙光菩萨，即文殊菩萨。德从十四心从一，十即艮土之灵，四为先天一炁法身佛，即摩尼珠王，即玄德，即文殊菩萨。可见，顶上肉髻有十四摩尼珠的药王菩萨即玄德之文殊菩萨。
《法华义疏》卷一载：“药王菩萨有二种身：一、如意珠王身，能与一切乐，依此立名故云宝掌也。二、药树王身，见闻之者无不苦灭，依此立名称药王。”
解读：
如意珠王即摩尼珠王，即先天一炁法身佛，即文殊菩萨。如意珠为宝，在艮土中，艮土为手为掌，故称宝掌。而药树身和莲花身一样代表巽灵白水素女。药王菩萨即坐在莲花上的文殊菩萨。白水素女即药上菩萨，所以药王菩萨总是与药上菩萨在一起，药上菩萨即药王菩萨手中所持的药树，即文殊菩萨手中所持的莲花，即太上老君所持的扇子。药王菩萨以药树王之身显现，为药树王之心，有药树王身的药王菩萨即有莲花身的佛，药树王即药上菩萨。
《楞严经》载，药王、药上两位菩萨是从味尘而开悟：“药王、药上二法王子，并在会中五百梵天，即从座起，顶礼佛足，而白佛言：我无始劫，为世良医，口中尝此娑婆世界草木金石，名数凡有十万八千。如是悉知，苦酢咸淡甘辛等味，并诸和合俱生变异，是冷是热，有毒无毒，悉能遍知。承事如来，了知味性，非空非有，非即身心，非离身心，分别味因，从是开悟。蒙佛如来印我昆季药王、药上二菩萨名，今于会中为法王子。因味觉明，位登菩萨。佛问圆通，如我所证，味因为上。”
解读：
药王菩萨即遍尝百草的药神神农炎帝、即药王孙思邈、即药仙吕洞宾，即神医扁鹊。药王菩萨之形象，通常为顶戴宝冠，左手握拳、置于腰间，右手屈臂、置放胸前，而以拇指、中指、无名指执持药树。药树为阴木，即莲花仙子白水素女，即孙思邈所持的藜杖。
药王菩萨、孙思邈和扁鹊都是农历四月二十八日的诞辰日，也有很多地方认为神农炎帝也生于四月二十八日。
从以上可见，中国的中草药知识都是药王菩萨所传，即文殊菩萨所传，即神农炎帝所传，即太上老君所传。《新白娘子传奇》中开保安堂和保和堂的许仙就是药王菩萨下凡，即神农炎帝再来。
